摘要:本研究聚焦噬菌體納米抗體展示庫(kù)電轉(zhuǎn)化效率提升難題。通過(guò)系統(tǒng)調(diào)控電轉(zhuǎn)化關(guān)鍵參數(shù),如電壓、電容、脈沖時(shí)長(zhǎng)及感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)等,經(jīng)多輪對(duì)比實(shí)驗(yàn),成功優(yōu)化條件,顯著提高轉(zhuǎn)化效率,為高質(zhì)量納米抗體庫(kù)構(gòu)建及篩選奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),拓展其在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用潛能。
噬菌體展示技術(shù)作為新興的強(qiáng)大生物技術(shù)平臺(tái),在抗體工程領(lǐng)域占據(jù)關(guān)鍵地位,尤其是納米抗體的篩選與開(kāi)發(fā),依賴高效的噬菌體展示庫(kù)構(gòu)建。電轉(zhuǎn)化作為將外源 DNA 高效導(dǎo)入感受態(tài)細(xì)胞的關(guān)鍵步驟,其效率直接關(guān)乎噬菌體展示庫(kù)的質(zhì)量與多樣性。然而,當(dāng)前常規(guī)電轉(zhuǎn)化條件在噬菌體納米抗體展示庫(kù)構(gòu)建時(shí)存在轉(zhuǎn)化效率不穩(wěn)定、細(xì)胞損傷大等諸多局限,嚴(yán)重制約后續(xù)功能抗體篩選及相關(guān)應(yīng)用拓展,亟待精準(zhǔn)優(yōu)化以突破瓶頸。
菌株:選用大腸桿菌 TG1 菌株,其具備高效攝取外源 DNA 能力且利于噬菌體增殖,確保實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)可靠性,購(gòu)自專業(yè)菌種保藏中心,復(fù)蘇后經(jīng)嚴(yán)格平板劃線純化,-80°C 甘油保存?zhèn)溆谩?/p>
載體:采用特定噬菌體載體,經(jīng)基因工程改造,含有納米抗體基因片段插入位點(diǎn)及篩選標(biāo)記,由實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建并測(cè)序驗(yàn)證準(zhǔn)確性,提取純化后 -20°C 儲(chǔ)存,濃度與純度滿足實(shí)驗(yàn)要求。
試劑:優(yōu)質(zhì)電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞制備試劑盒,確保制備細(xì)胞高效感受態(tài);各類限制性內(nèi)切酶、連接酶等分子生物學(xué)工具酶,均為高活性產(chǎn)品;電轉(zhuǎn)化緩沖液自行精確配制,含適量蔗糖、鎂離子等關(guān)鍵成分,調(diào)節(jié)滲透壓與離子強(qiáng)度。
電壓梯度設(shè)置:以常規(guī)電轉(zhuǎn)化儀為平臺(tái),設(shè)置 1.0 kV、1.25 kV、1.5 kV、1.75 kV、2.0 kV 五組不同電壓,每組至少 3 個(gè)平行樣本,固定電容 25 μF、脈沖時(shí)長(zhǎng) 5 ms,探究電壓對(duì)轉(zhuǎn)化效率及細(xì)胞存活率影響,記錄轉(zhuǎn)化后菌落數(shù)及細(xì)胞生長(zhǎng)曲線。
電容調(diào)節(jié):選定最佳電壓后,將電容設(shè)為 15 μF、20 μF、25 μF、30 μF、35 μF,維持電壓與脈沖時(shí)長(zhǎng)不變,重復(fù)轉(zhuǎn)化操作,分析電容變化下電穿孔效果差異,通過(guò)流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞穿孔率輔助評(píng)估。
脈沖時(shí)長(zhǎng)優(yōu)化:在優(yōu)化電壓、電容基礎(chǔ)上,對(duì)脈沖時(shí)長(zhǎng)從 3 ms 至 7 ms 以 1 ms 間隔細(xì)分測(cè)試,深入剖析短暫強(qiáng)脈沖與稍長(zhǎng)弱脈沖對(duì) DNA 攝入及細(xì)胞完整性不同作用機(jī)制,結(jié)合顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)完整性。
培養(yǎng)溫度精細(xì)調(diào)控:對(duì)比 30°C、32°C、34°C、36°C、37°C 培養(yǎng)大腸桿菌至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期收獲制備感受態(tài),考察不同溫度下細(xì)胞膜流動(dòng)性、蛋白表達(dá)差異對(duì)轉(zhuǎn)化接納能力影響,測(cè)定細(xì)胞膜脂肪酸飽和度等指標(biāo)。
預(yù)處理添加劑篩選:向感受態(tài)制備體系分別添加 0.5% DMSO、1% 甘油、0.2 M 甜菜堿等化學(xué)試劑,探究其對(duì)細(xì)胞膜通透性、細(xì)胞抗電擊能力提升作用,利用熒光探針監(jiān)測(cè)細(xì)胞膜電位變化驗(yàn)證添加劑效果。
復(fù)蘇培養(yǎng)基改良:設(shè)計(jì)含不同濃度葡萄糖、氨基酸組合復(fù)蘇培養(yǎng)基,旨在快速補(bǔ)充細(xì)胞能量、修復(fù)損傷,對(duì)比標(biāo)準(zhǔn) LB 培養(yǎng)基,監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)化細(xì)胞起始生長(zhǎng)速率及延滯期時(shí)長(zhǎng)。
復(fù)蘇時(shí)間精準(zhǔn)確定:設(shè)定 30 min、60 min、90 min、120 min、150 min 不同復(fù)蘇時(shí)長(zhǎng),考察細(xì)胞從電沖擊損傷恢復(fù)及外源 DNA 穩(wěn)定表達(dá)所需最短且高效時(shí)段,通過(guò)實(shí)時(shí)定量 PCR 檢測(cè)噬菌體基因轉(zhuǎn)錄起始時(shí)間。
隨電壓升高,轉(zhuǎn)化效率呈先升后降趨勢(shì),1.5 kV 時(shí)菌落數(shù)達(dá)峰值,較 1.0 kV 提升約 3 倍;但高于 1.75 kV 后,細(xì)胞存活率急劇下降,顯微鏡下可見(jiàn)大量破碎細(xì)胞,表明過(guò)高電壓雖增強(qiáng) DNA 驅(qū)動(dòng)力卻嚴(yán)重破壞細(xì)胞膜,權(quán)衡效率與細(xì)胞存活,1.5 kV 為初步優(yōu)選電壓,后續(xù)實(shí)驗(yàn)以此為基拓展優(yōu)化。
電容從 15 μF 增至 25 μF,轉(zhuǎn)化效率穩(wěn)步上升,25 μF 時(shí)達(dá)平臺(tái)期,繼續(xù)增大電容無(wú)顯著提升,反因電場(chǎng)能量過(guò)度積累微增細(xì)胞損傷,結(jié)合穿孔率數(shù)據(jù),確認(rèn) 25 μF 為適配電容,與選定電壓協(xié)同構(gòu)建適宜電穿孔電場(chǎng)強(qiáng)度與時(shí)長(zhǎng)組合,保障 DNA 足量進(jìn)入細(xì)胞且維持細(xì)胞活性。
4 ms 脈沖時(shí)長(zhǎng)轉(zhuǎn)化效率優(yōu),短于此時(shí)長(zhǎng) DNA 進(jìn)入不充分,長(zhǎng)于則加劇細(xì)胞應(yīng)激損傷,細(xì)胞膜完整性受損嚴(yán)重,特定基因表達(dá)失調(diào),該時(shí)長(zhǎng)平衡電脈沖刺激與細(xì)胞耐受,使外源 DNA 精準(zhǔn)、高效整合入細(xì)胞基因組,為后續(xù)噬菌體復(fù)制與展示奠定基礎(chǔ)。
34°C 培養(yǎng)制備感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化表現(xiàn)優(yōu)良,細(xì)胞膜流動(dòng)性適中,關(guān)鍵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白豐度高,利于 DNA 結(jié)合與內(nèi)化;1% 甘油添加組細(xì)胞膜穩(wěn)定性增強(qiáng),電擊后維持較好完整性,減少內(nèi)容物泄漏,兩者協(xié)同預(yù)處理使轉(zhuǎn)化效率較原始條件提升近 5 倍,極大擴(kuò)充可轉(zhuǎn)化細(xì)胞基數(shù)。
含 0.2% 葡萄糖與適量脯氨酸、纈氨酸的復(fù)蘇培養(yǎng)基顯著縮短細(xì)胞延滯期,加速修復(fù)損傷恢復(fù)生長(zhǎng);90 min 復(fù)蘇時(shí)長(zhǎng)足以完成細(xì)胞膜修復(fù)、DNA 轉(zhuǎn)錄起始及噬菌體組裝關(guān)鍵進(jìn)程,過(guò)早終止復(fù)蘇致轉(zhuǎn)化不穩(wěn)定,過(guò)長(zhǎng)則營(yíng)養(yǎng)耗盡抑制生長(zhǎng),優(yōu)化后整體轉(zhuǎn)化效率提升約 60%,保障高活性噬菌體展示庫(kù)產(chǎn)出。
本研究經(jīng)全方面、精細(xì)化電轉(zhuǎn)化條件探索,確定 1.5 kV 電壓、25 μF 電容、4 ms 脈沖時(shí)長(zhǎng)組合,配合 34°C 培養(yǎng)及甘油預(yù)處理感受態(tài)細(xì)胞,采用特制復(fù)蘇培養(yǎng)基與 90 min 時(shí)長(zhǎng),構(gòu)建全新高效電轉(zhuǎn)化流程。該優(yōu)化體系大幅提升噬菌體納米抗體展示庫(kù)轉(zhuǎn)化效率,降低細(xì)胞損傷,增強(qiáng)庫(kù)多樣性與功能性,為納米抗體研發(fā)提供更優(yōu)質(zhì)資源庫(kù),助力精準(zhǔn)靶向治療、生物傳感等前沿應(yīng)用突破技術(shù)屏障,開(kāi)拓廣闊前景,后續(xù)將聚焦大規(guī)模驗(yàn)證及跨體系適配性研究。