一、PCR結(jié)果分析的基本步驟:?
1.基線設(shè)置?:實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)的基線是指在PCR的初始循環(huán)期間的信號(hào)水平,通常是3至15個(gè)循環(huán)之間,此時(shí)熒光信號(hào)幾乎沒有變化,可以認(rèn)為是背景或反應(yīng)的噪音。
2. ?閾值設(shè)定?:?qPCR的閾值代表的是明顯超出基線的擴(kuò)增信號(hào)水平,用以區(qū)分明確的擴(kuò)增信號(hào)和背景。通常qPCR儀器自帶軟件會(huì)自動(dòng)將閾值設(shè)置為基線熒光值標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。
3. ?CT值計(jì)算?:Ct是指熒光信號(hào)超過閾值時(shí)對應(yīng)的循環(huán)數(shù),Ct值與目的基因的起始量成反比,可用于計(jì)算DNA初始拷貝數(shù)。
4. ?擴(kuò)增曲線分析?:擴(kuò)增曲線有兩種展現(xiàn)形式,一種是線性,一種是對數(shù)形式。通常用CT來推算樣品中樣品的濃度,CT值越高說明模板濃度越低。
5. ?標(biāo)準(zhǔn)曲線?:將已知濃度的樣品(標(biāo)準(zhǔn)品)經(jīng)過梯度稀釋后分別取樣進(jìn)行熒光定量PCR,得到的一系列Ct值與Log模板數(shù)對應(yīng)可以得到一個(gè)相關(guān)的曲線,即標(biāo)準(zhǔn)曲線。這個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線可以用來判斷熒光定量PCR體系的優(yōu)劣。
6. ?熔解曲線分析?:PCR產(chǎn)物進(jìn)行逐步升溫監(jiān)測,可以看到在達(dá)到其解鏈溫度時(shí),熒光信號(hào)會(huì)有一個(gè)忽然的下降。理論上如果PCR得到特異性產(chǎn)物則只有一個(gè)Tm值,在溶解曲線上表示只有單峰存在。如果是多相峰,可以判斷產(chǎn)物不是單一的,發(fā)生了非特異擴(kuò)增。
二、不同PCR技術(shù)的結(jié)果分析方法
1. ?第一代PCR技術(shù)?:采用瓊脂糖電泳的方式對PCR產(chǎn)物進(jìn)行分析,通過電泳判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的大小,用于臨床檢測。
2. ?第二代PCR技術(shù)?:熒光定量PCR(qPCR),通過設(shè)置基線、閾值和CT值進(jìn)行定量分析,適用于需要精確測量DNA或RNA含量的實(shí)驗(yàn)。
3. ?第三代PCR技術(shù)?:以微滴化處理步驟為主要特征,提高了檢測的靈敏度和特異性,適用于更復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)需求。
三、具體實(shí)驗(yàn)操作步驟
1. ?樣品處理?:將樣品進(jìn)行稀釋和離心處理,確保DNAwanquan裂解和分離。
2. ?PCR反應(yīng)?:按照試劑盒說明書操作,將反應(yīng)管與凍干成分一起離心,添加緩沖液和引物/探針/核苷酸混合物,進(jìn)行PCR反應(yīng)。
3. ?結(jié)果分析?:通過基線、閾值、CT值和擴(kuò)增曲線等參數(shù)分析PCR結(jié)果,比較實(shí)驗(yàn)組和對照組的差異,確定基因表達(dá)的變化。
天津益元利康生物科技有限公司可以提供PCR實(shí)驗(yàn)所需全部試劑耗材,有需要請聯(lián)系哦!
相關(guān)產(chǎn)品
免責(zé)聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對其真實(shí)性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。