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Bio-Techne
中級(jí)會(huì)員 | 第6年

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單細(xì)胞分選在生物信息學(xué)中起到一個(gè)重要角色

時(shí)間:2023/6/25閱讀:168
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  單細(xì)胞分選(SingleCellSorting)技術(shù)是一種可以將單個(gè)細(xì)胞從復(fù)雜的混合樣品中進(jìn)行快速篩選和富集的高通量技術(shù)。該技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于生物信息學(xué)研究中,尤其在腫瘤、免疫學(xué)、發(fā)育生物學(xué)等領(lǐng)域起到了至關(guān)重要的作用。
  
  在單細(xì)胞分選過(guò)程中,流式細(xì)胞儀被廣泛應(yīng)用于實(shí)現(xiàn)對(duì)各類類型組成樣品中具有特定熒光或其他標(biāo)志性抗原的單個(gè)活體細(xì)胞進(jìn)行誘導(dǎo)及捕獲,并高效地回收目標(biāo)基因組或轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)所需數(shù)量。
  
  通過(guò)這種方式獲取到大規(guī)模而又完整的布谷鳥(niǎo)圖譜(bird's-eyeview),我們就能夠更加全面準(zhǔn)確地揭示每個(gè)調(diào)控區(qū)域?qū)虮磉_(dá)影響的精度與范圍。
  
  除此之外,在當(dāng)前越來(lái)越多地采取“全基因組”水平上進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘時(shí),利用該項(xiàng)技術(shù)篩選出人群內(nèi)感染率較高者以及不同亞型間差異顯著性分析也變得更為便利和直觀。同時(shí)在檢驗(yàn)致癌基因及其調(diào)控機(jī)制、研究分化過(guò)程和細(xì)胞信號(hào)傳遞通路等方面,單細(xì)胞分選也發(fā)揮了重要的作用。
  
  但是在應(yīng)用中,仍然存在一些限制和難以克服的技術(shù)問(wèn)題。例如,在大樣品量與小樣品量之間做抉擇時(shí)會(huì)帶來(lái)不同模式的噪聲或誤差;同時(shí),在測(cè)序過(guò)程中出現(xiàn)高達(dá)10-25%丟失率將會(huì)使得數(shù)據(jù)質(zhì)量下降;此外還有成本高昂等問(wèn)題需要考慮。
  

單細(xì)胞分選技術(shù)應(yīng)用

 

  總體而言,盡管單細(xì)胞分選技術(shù)面臨著許多挑戰(zhàn)和困難,但它已經(jīng)被證明是一個(gè)強(qiáng)有力的工具來(lái)深入理解生物信息學(xué)領(lǐng)域復(fù)雜流程。未來(lái)我們可以通過(guò)對(duì)該項(xiàng)技術(shù)進(jìn)行持續(xù)改進(jìn)與優(yōu)化,并結(jié)合其他科研手段實(shí)現(xiàn)更加全面地研究方法論并為各類相關(guān)應(yīng)用任務(wù)提供支撐。

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