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產(chǎn)品簡介
詳細(xì)介紹
納米孔測序儀 MinION MK1C是一款多方位集成的、*便攜式測序和分析測序儀,利用更*的納米孔測序技術(shù),實現(xiàn)對DNA和RNA分子的高通量單分子實時測序。
原理:單分子納米孔測序技術(shù)。
品牌:Oxford Nanopore Technologies(ONT),UK英國
應(yīng)用類型:全基因組測序、靶向測序、RNA測序、宏基因組測序、表觀遺傳學(xué)等。
樣本類型:基因組DNA、擴(kuò)增子/PCR產(chǎn)物、cDNA、RNA。
環(huán)境:
儲存環(huán)境:溫度要求:10~30℃、濕度要求:5%~95%
工作環(huán)境:野外/現(xiàn)場、實驗室、移動實驗車
溫度要求:18~25℃
濕度要求:10%~80%
電源要求:100~240 VAC (50/60Hz)
其他要求:網(wǎng)絡(luò)
儀器參數(shù):
流動槽(flow cell):1個MinION/Flongle測序芯片槽
體積:3*14*11.4 cm(高30mm | 寬140mm | 深114mm)
重量:420g
預(yù)裝軟件:Linux操作系統(tǒng)、MinKNOW、Guppy、EPI2ME
CPU:ARM 6核處理器
GPU:256核GPU
內(nèi)存:8 GB RAM
儲存:內(nèi)置1 TB固態(tài)硬盤,支持USB及SD移動存儲
觸摸屏:OLED觸摸屏
網(wǎng)絡(luò)支持:Wi-Fi,GSM、UMTS及LTE模式的蜂窩網(wǎng)
儀器性能:
測序通道數(shù)量:512(2048)/MinION測序芯片槽或216/Flongle測序芯片槽;
起始樣品量:10pg~5ug;
測序樣品上樣量:≥100ng,75ul;
運行時間:1min~48hrs(按需可控);
測序速度:450bp/s(DNA)、70bp/s(RNA);
運行數(shù):1個flow cell實驗;
芯片使用壽命:72 hrs;
原始數(shù)據(jù)存儲。
性能指標(biāo)
文庫制備時間:10min(Rapid)或2hrs(Ligation);
DNA/RNA直接測序(RNA無需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測序);
獲取序列時間:運行2min;
序列條數(shù):4.4 Million(百萬)reads(以10kb長度計算);
讀長長度:從200bp至2Mb;
測序數(shù)據(jù)產(chǎn)量:10~30 Gb/MinION flow cel;200Mb~2Gb/Flongle flow cel;
堿基質(zhì)量:99%;
堿基修飾:直接檢測堿基修飾信息(甲基化檢測);
分析Nanopore測序數(shù)據(jù)的工具:≥30種、開源;
集成設(shè)備:儀器本身為高性能計算機,可實時完成數(shù)據(jù)獲取,存儲以及堿基轉(zhuǎn)換(basecalling)。
納米孔測序儀 MinION MK1C優(yōu)點:
MinION Mk1C結(jié)合了MinION實時快速可手持測序、Flongle強大的集成計算和高分辨率觸摸屏的優(yōu)點, 能夠為DNA/RNA測序提供多方位的解決方案。
安裝簡便:多方位集成的、*便攜式測序和分析測序儀,沒有復(fù)雜的激光或光路系統(tǒng),直接連接電源即可使用,無需日常維護(hù)。
單分子測序:DNA/RNA可直接測序,無需PCR擴(kuò)增,免除PCR擴(kuò)增帶來的錯誤和GC偏差,快速、實時。
直接RNA測序:提取RNA無需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測序。
甲基化檢測:堿基修飾基于電信號的差異檢測堿基,在DNA/RNA測序同時可直接檢測堿基修飾。
數(shù)據(jù)產(chǎn)生快速:提供更*的單分子實時測序,上機后2分鐘產(chǎn)生堿基序列數(shù)據(jù)。并可以根據(jù)實驗需求設(shè)置測序反應(yīng)時間。
實時分析:可在測序同時完成原始電信號堿基讀?。‵ast5 To FastQ)、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制(QC)、barcode拆分(Demultiplexing)、序列比對(Alignment)、基因組組裝(Assembly)、宏基因組分析(Metagenomics)、擴(kuò)增子分析(Amplicon)、測序錯誤校正(Error correction)、變異分析(Variant calling)、堿基修飾(Base modification