近期,QD中國科學實驗中心全新引進了由英國iotaSciences公司推出的單細胞可視化分選培養(yǎng)系統(tǒng)—isoCell。該設備具有高通量、自動化、高成活率等特點,可實現(xiàn)單克隆細胞系構建、微生物分選與培養(yǎng)、單細胞分選、單細胞組學研究等功能。
日前,該設備樣機已完成調試,全國樣機巡展活動正式拉開帷幕。截止目前,已在國家干細胞庫、浙江之江實驗室、中國醫(yī)科大學等地進行了樣機測試,獲得了用戶的好評。
單細胞可視化分選培養(yǎng)系統(tǒng)—isoCell巡展測試現(xiàn)場
傳統(tǒng)的單細胞分離手段無法確保所獲樣品中100%僅有一個單細胞,可能存在多個細胞或細胞團,從而導致下游后續(xù)的實驗產生誤差。此外,傳統(tǒng)構建單克隆細胞系技術受限于單細胞的高度敏感性,成功率較低,也無法保證每一個單克隆細胞系均來自單個細胞。isoCell采用的GRID單細胞腔室技術,可以保證100%準確的單細胞分選,并在GRID中可高度自動化地直接培育單克隆細胞系,成活率高達60%以上。同時,通過全流程可視化監(jiān)控,可保證每一個單克隆細胞系均來自于挑選的單個細胞。isoCell的分選、培養(yǎng)條件溫和,可以顯著提高單細胞克隆的存活率。此外,isoCell還可以將單細胞樣品按照特定的體積直接轉移到96孔板或PCR管中,實現(xiàn)單細胞下游應用的無縫銜接,確保后續(xù)單細胞組學信息的完整性。
單細胞可視化分選培養(yǎng)系統(tǒng)—isoCell樣機
人類誘導多能干細胞(hiPSCs)的單細胞克隆
人類誘導多能干細胞(hiPSCs)構建單克隆細胞系培養(yǎng)步驟繁瑣,細胞對異常的處理和操作非常敏感,傳統(tǒng)單細胞分選容易導致細胞和遺傳毒性應激的積累,進而導致不良分化和多能性喪失。使用isoCell可以溫和且自動化地將人類誘導多能干細胞(hiPSCs)進行單細胞分選并進行培養(yǎng),高效地培養(yǎng)hiPSCs單克隆細胞系,顯著提高了細胞分離與克隆效率(如下圖所示)。
Day8 hiPSCs單克隆在GRID中長成
100%單細胞分離效率,80%左右單克隆形成效率
單細胞測序
傳統(tǒng)單細胞測序需對單細胞進行全基因組擴增(WGA),然而傳統(tǒng)單細胞WGA受到如何獲得單個細胞并轉移到小體積WGA反應中的限制。通過isoCell可自動將K562細胞拾取并轉移到含3.5 µl scWGA試劑的PCR管中,實現(xiàn)scWGA反應的無縫銜接。瓊脂糖凝膠電泳結果顯示結果如下圖所示,單細胞WGA的DNA樣本(+)中兩種基因均被特異性擴增,而陰性對照(-)中則沒有這兩種擴增產物,與預期結果符合。
100%單細胞分選效率
單細胞WGA的DNA樣本擴增結果
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