DIA蛋白質(zhì)組學(xué)
- 公司名稱(chēng) 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號(hào)
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷(xiāo)商
- 更新時(shí)間 2024/3/11 13:53:04
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實(shí)驗(yàn)介紹
DIA(data-independent acquisition,數(shù)據(jù)非依賴(lài)性采集)技術(shù)是近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的一種新的質(zhì)譜技術(shù),屬于非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)方法。采用數(shù)據(jù)非依賴(lài)性掃描模式:將質(zhì)譜整個(gè)全掃描范圍分為若干個(gè)窗口,然后對(duì)每個(gè)窗口中的所有離子進(jìn)行檢測(cè)、碎裂,從而無(wú)遺漏、無(wú)差異地獲得樣本中所有離子的信息。從而降低樣本檢測(cè)的缺失值,同時(shí)提高定量準(zhǔn)確性和重復(fù)性,實(shí)現(xiàn)大樣本隊(duì)列中高穩(wěn)定,高精準(zhǔn)的蛋白質(zhì)組定量分析。 與DDA技術(shù)相比,DIA技術(shù)的優(yōu)勢(shì)包括:(1)采集所有的離子信息,實(shí)現(xiàn)更高的數(shù)據(jù)覆蓋度;(2)減少采集的隨機(jī)性,實(shí)現(xiàn)的檢測(cè)重現(xiàn)性、穩(wěn)定性;(3)采用碎片離子定量,定量精密度、準(zhǔn)確性、線性范圍大大提高。基于上述技術(shù)優(yōu)勢(shì),DIA技術(shù)尤其適用于大規(guī)模樣本的高度覆蓋、穩(wěn)定和可追溯地分析。
實(shí)驗(yàn)流程
應(yīng)用方向
DIA專(zhuān)為大樣本量分析應(yīng)用而生:
? 疾病精準(zhǔn)分型、品系研究比較:DIA實(shí)現(xiàn)更加準(zhǔn)確的定量結(jié)果,從而更精確反映疾病亞型、品系間的差異;
? 生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):DIA接近MRM的定量能力,實(shí)現(xiàn)標(biāo)志物篩選與初步驗(yàn)證過(guò)程合二為一;
? 生物樣本信息庫(kù)構(gòu)建:DIA可實(shí)現(xiàn)生物信息的完整保存,為后續(xù)回溯分析提供保障。
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)與分析 | 樣本蛋白質(zhì)及肽段鑒定柱狀圖、PCA分布圖、定量差異統(tǒng)計(jì)分析 |
生物信息學(xué)分析 | GO及GO富集、KEGG及KEGG富集分析、PPI互作網(wǎng)絡(luò)與module分析 |
差異上下調(diào)蛋白KEGG蝴蝶圖、KEGG通路功能歸屬等 | |
高級(jí)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
標(biāo)志物篩選 | 集成機(jī)器學(xué)習(xí)、LASSO回歸分析、標(biāo)志物panel、ROC分析 |
分子分型分析 | 無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)分型分析、蛋白質(zhì)組+轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析、激酶分析 |
臨床表征與組學(xué)結(jié)果聯(lián)合分析 | |
疾病相關(guān)功能模塊分析 | WGCNA共表達(dá)分析 |
生存曲線分析 | 臨床分型與生存曲線分析 |
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 全掃描模式:數(shù)據(jù)非依賴(lài)性采集模式,大大減少高豐度干擾,全面采集高低豐度信號(hào),數(shù)據(jù)覆蓋度提高近40%
? 超高重現(xiàn)性、穩(wěn)定性:大樣本鑒定重復(fù)率提升近40%,定量精密度提升近1倍
? 超高定量準(zhǔn)確度:定量能力接近金標(biāo)準(zhǔn)SRM/MRM靶向技術(shù)