ERCC1密碼子118單核苷酸多態(tài)性細(xì)胞轉(zhuǎn)染模型構(gòu)建與功能分析
摘要
ERCC1基因密碼子118單核苷酸多態(tài)性(C118T)的細(xì)胞轉(zhuǎn)染模型,并探討其功能影響。通過定點(diǎn)突變技術(shù)構(gòu)建野生型與突變型ERCC1表達(dá)載體,利用威尼德電穿孔儀轉(zhuǎn)染至HEK293T細(xì)胞,驗(yàn)證轉(zhuǎn)染效率及SNP位點(diǎn)。功能分析表明,突變型ERCC1顯著降低DNA損傷修復(fù)能力并增強(qiáng)順鉑敏感性。結(jié)果為ERCC1基因多態(tài)性與化療耐藥性關(guān)聯(lián)研究提供模型支持。
引言
ERCC1(Excision Repair Cross-Complementation Group 1)是核苷酸切除修復(fù)(NER)通路的核心基因,其表達(dá)水平與鉑類化療藥物耐藥性密切相關(guān)。密碼子118(C118T)單核苷酸多態(tài)性(SNP)導(dǎo)致氨基酸由丙氨酸替換為蘇氨酸,可能影響ERCC1蛋白功能及穩(wěn)定性。然而,現(xiàn)有研究多基于臨床樣本關(guān)聯(lián)分析,缺乏直接的功能驗(yàn)證模型。
ERCC1-C118T SNP的體外細(xì)胞模型,結(jié)合基因編輯與功能分析,明確該多態(tài)性對DNA修復(fù)能力及藥物敏感性的影響,為個體化化療方案設(shè)計提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
實(shí)驗(yàn)部分
1. 質(zhì)粒構(gòu)建與定點(diǎn)突變
采用PCR擴(kuò)增技術(shù)從人基因組DNA中獲取ERCC1基因全長序列,克隆至pcDNA3.1載體。針對密碼子118(C>T)設(shè)計特異性引物,通過重疊延伸PCR引入突變。反應(yīng)體系含某試劑高保真DNA聚合酶,擴(kuò)增條件:98℃預(yù)變性2分鐘,30個循環(huán)(98℃ 10秒,60℃ 15秒,72℃ 2分鐘),72℃延伸5分鐘。突變質(zhì)粒經(jīng)威尼德分子雜交儀驗(yàn)證后,送測序確認(rèn)SNP位點(diǎn)。
2. 細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染
HEK293T細(xì)胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,37℃、5% CO?條件下傳代。取對數(shù)生長期細(xì)胞,接種于6孔板(密度1×10?/孔),24小時后分別轉(zhuǎn)染野生型(ERCC1-WT)與突變型(ERCC1-C118T)質(zhì)粒。轉(zhuǎn)染使用某試劑脂質(zhì)體法,同時設(shè)置空載體對照組。轉(zhuǎn)染后48小時,通過威尼德紫外交聯(lián)儀檢測熒光報告基因表達(dá)效率,篩選穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞株。
3. SNP位點(diǎn)功能驗(yàn)證
提取轉(zhuǎn)染細(xì)胞總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,采用qRT-PCR定量ERCC1 mRNA表達(dá)水平。蛋白水平通過Western blot檢測,一抗為某試劑ERCC1單克隆抗體(1:1000),二抗為HRP標(biāo)記羊抗鼠IgG(1:5000)。使用威尼德原位雜交儀進(jìn)行免疫熒光染色,觀察ERCC1蛋白亞細(xì)胞定位。
4. 功能分析
(1)細(xì)胞增殖與凋亡實(shí)驗(yàn):CCK-8法檢測順鉑(0-20 μM)處理48小時后細(xì)胞存活率;Annexin V-FITC/PI雙染法流式檢測凋亡率。
(2)DNA損傷修復(fù)能力評估:UV-C照射(20 J/m2)誘導(dǎo)DNA損傷,彗星實(shí)驗(yàn)(單細(xì)胞凝膠電泳)定量DNA碎片化程度;γ-H2AX免疫熒光染色分析雙鏈斷裂修復(fù)效率。
結(jié)果與討論
1. 模型構(gòu)建成功性驗(yàn)證
測序結(jié)果顯示,突變型質(zhì)粒C118T位點(diǎn)匹配設(shè)計。Western blot證實(shí)轉(zhuǎn)染細(xì)胞中ERCC1蛋白表達(dá)量顯著高于對照組(P<0.01),且突變型蛋白分子量無顯著差異。
2. SNP對DNA修復(fù)功能的影響
彗星實(shí)驗(yàn)顯示,突變型ERCC1細(xì)胞在UV照射后尾矩較野生型增加35%(P<0.05),表明DNA修復(fù)能力下降。γ-H2AX焦點(diǎn)數(shù)量在突變型細(xì)胞中持續(xù)升高至24小時,而野生型在12小時即顯著減少。
3. 順鉑敏感性差異
突變型細(xì)胞經(jīng)10 μM順鉑處理后,存活率較野生型降低42%(P<0.01),凋亡率增加2.3倍(P<0.001)。提示C118T多態(tài)性可能通過削弱NER功能增強(qiáng)化療藥物毒性。
結(jié)論
ERCC1-C118T SNP細(xì)胞模型,證實(shí)該位點(diǎn)突變導(dǎo)致DNA損傷修復(fù)能力下降及順鉑敏感性升高。此模型為ERCC1多態(tài)性機(jī)制研究及臨床化療療效預(yù)測提供了可靠工具。
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