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聚焦 RNA,安捷倫 Cary 3500 分光光度計智啟純度評估新高度

來源:安捷倫科技(中國)有限公司   2025年02月27日 15:28  

在生物制藥領(lǐng)域,核糖核酸(RNA)的質(zhì)量控制至關(guān)重要,直接關(guān)系到基因表達研究的可靠性和藥物制造的安全性。傳統(tǒng)RNA純度評估通常依賴于 260nm 和 280nm 的吸光度比值測量。然而,這種方法存在局限性,因為RNA樣本緩沖液的 pH 值和離子強度變化會影響 A260/280 比值,進而影響純度評估的準確性。

 

聚焦以上挑戰(zhàn),Agilent 的研究團隊精心設(shè)計一系列實驗,深入探討了這些因素對 RNA 純度評估的影響,并據(jù)此提出了改進方法。本研究使用 Agilent Cary 3500 Multicell Peltier UV-Vis 分光光度計進行實驗,并借助 Agilent Cary UV Workstation 軟件完成數(shù)據(jù)采集。

實驗包括三個部分:

1

研究 pH 值和 Na2HPO4 濃度對 RNA 的 A260/280 比值和吸收度的影響。

2

研究 pH 值和離子強度對 RNA 中溶解的 BSA 蛋白的 A260/280 比值的影響。

3

對 HeLa RNA 在 1 mM Na2HPO4、TNE 緩沖液和水中的 UV 吸收掃描分析。

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圖 1. pH 值和 Na2HPO4 的濃度在(A)A260/280 比率和 (B)吸光度上的影響。(C)260 nm 和 280 nm 處吸光度的百分比變化

實驗數(shù)據(jù)顯示,隨著 RNA 樣本緩沖液 pH 值和 Na2HPO4 濃度的增加,A260/280 比值顯著上升,尤其是在 pH 值 7.2 至 8.6 和 Na2HPO濃度 0.02 至 1 mM 的區(qū)間內(nèi),其增長尤為明顯。這一發(fā)現(xiàn)表明,通過精確控制緩沖液的pH值和離子強度,可以更準確地評估 RNA 的純度。

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圖 2. 在蛋白質(zhì)存在或不存在的情況下,pH 值和離子強度對 RNA A260/280 比率的影響。(A) 在 10 mM Na2HPO中分別加入 RNA、蛋白質(zhì)和 RNA 加標蛋白質(zhì)的吸光度曲線(B) RNA、蛋白質(zhì)和 RNA 加標蛋白質(zhì)分別在 0.01 至 10 mM Na2HPO4 中的 A260/280 比率圖

可觀察到,在 10 mM Na2HPO4 中加入蛋白質(zhì)前后,RNA 的 A260/280 比值從 2.15 降至 1.61,表明蛋白質(zhì)改變了 RNA 的吸收度。且在水和 1.0 mM Na2HPO4 中,RNA與蛋白質(zhì)的 A260/280 比值分別下降了 19.1% 和 26.6%,表明在堿性條件下 RNA 樣本中蛋白質(zhì)污染的檢測靈敏度顯著提高,這對于確保 RNA 樣本保持高質(zhì)量具有重要意義。

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圖 3. 在水、TNE 緩沖液和 1 mM Na2HPO中測試 HeLa RNA 的吸光度曲線

1 mM Na2HPO和 TNE 緩沖液中的 RNA 吸收光譜相似,而水中的 RNA 光譜則向更高波長移動。建議使用堿性緩沖液溶解提取的 RNA。

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圖 4. Agilent Cary 3500 Multicell Peltier UV-Vis 分光光光度計硬件與軟件設(shè)置(內(nèi)置算法)

Agilent Cary 3500 Multicell Peltier UV-Vis 分光光度計在相關(guān)研究中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。該設(shè)備設(shè)計創(chuàng)新,包括具備八個比色皿位置,極大地提高了測量效率。其可同時測量多個樣本的能力避免了遭受實驗變量干擾,增強了結(jié)果的可靠性。

此外,Cary 3500 的內(nèi)置方程軟件功能能夠自動計算 A260/280 比值,進一步提高了分析的吞吐量。該設(shè)備的軟件與 Agilent OpenLab 軟件套件兼容,能有效確保數(shù)據(jù)的安全獲取和存儲,符合 FDA 21 CFR Part 11、EU Annex 11 以及其他國家類似的法規(guī)要求。這使得 Agilent Cary 3500 分光光度計成為受監(jiān)管環(huán)境中 RNA 質(zhì)量控制的理想選擇。

 

通過深入探索與技術(shù)創(chuàng)新,Agilent 研究團隊成功破局難題,為科研人員提供了更為精準、高效率的 RNA 純度評估手段,確保 RNA 質(zhì)量控制全流程堅實可靠。更多精彩詳情與生物制藥領(lǐng)域深度研究,將持續(xù)為您放送。

 

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