多重PCR建庫技術(shù)一覽

多重PCR建庫技術(shù)在微生物檢測(cè)中的應(yīng)用

16S rRNA擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)是微生物群落多樣性檢測(cè)常用的組學(xué)技術(shù)之一，該技術(shù)無需對(duì)微生物分離培養(yǎng)，直接提取樣本里面所有微生物的基因組，利用合適的通用引物擴(kuò)增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高變區(qū)或其他功能基因，采用高通量測(cè)序儀Miseq、Hiseq或Novaseq對(duì)其進(jìn)行測(cè)序，通過生物信息學(xué)分析可以獲得特定實(shí)驗(yàn)樣品中細(xì)菌、真菌或古菌等的物種組成、物種豐度、系統(tǒng)進(jìn)化、群落比較等諸多信息。

多重PCR建庫技術(shù)在動(dòng)植物檢測(cè)中的應(yīng)用

在傳統(tǒng)植物育種中，遺傳變異是通過視覺選擇進(jìn)行鑒定。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，分子標(biāo)記輔助育種解決了傳統(tǒng)利用表型篩選的作物育種方式成本高，周期長，費(fèi)時(shí)費(fèi)力的問題，逐步從“經(jīng)驗(yàn)育種”走向“精確育種”?；诙嘀豍CR和基于目標(biāo)區(qū)域基因組序列液相捕獲精準(zhǔn)定位SNP/INDEL基因型分型測(cè)序技術(shù)，將位點(diǎn)選擇高靈活性、樣品數(shù)量靈活性、高通量、高靈敏度、低成本多項(xiàng)優(yōu)勢(shì)有效結(jié)合，實(shí)現(xiàn)對(duì)全基因組上特定基因位點(diǎn)變異的高通量靶向篩查。

多重PCR靶向捕獲測(cè)序可用于對(duì)植物種群中的遺傳多樣性進(jìn)行分析。通過選擇性引物捕獲特定基因組區(qū)域并對(duì)多個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序比較,可以研究不同品種或種群中的遺傳差異和多態(tài)性,為植物種質(zhì)資源的保護(hù)和利用提供重要的分子標(biāo)記信息。

多重PCR技術(shù)可以針對(duì)多種植物病原真菌、細(xì)菌、病毒、線蟲等進(jìn)行靶向檢測(cè)，對(duì)病害的流行預(yù)警、溯源和防控管理等具有重要作用。

多重PCR建庫技術(shù)在疾病研究及相關(guān)檢測(cè)中的應(yīng)用

臨床腫瘤基因檢測(cè)主要有家族遺傳性腫瘤檢測(cè)（檢測(cè)胚系基因突變）、腫瘤組織體細(xì)胞基因突變檢測(cè)（腫瘤分子分型、用藥指導(dǎo)等）、游離DNA基因突變檢測(cè)（腫瘤動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)，耐藥評(píng)估等），腫瘤樣本靶向NGS分析的建庫方法主要有兩種：雜交捕獲法和擴(kuò)增法。泛生子一步法擴(kuò)增建庫技術(shù)（中國發(fā)明ZL201710218529.4)，利用特定引物通過一步PCR擴(kuò)增，結(jié)合生物信息算法分析，可檢測(cè)多種類型的變異信息，包括點(diǎn)突變、小片段插入/缺失、拷貝數(shù)變異、基因融合變異、甲基化修飾和RNA表達(dá)量變化等。除用于多種靶向藥基因突變進(jìn)行同時(shí)鑒定以指導(dǎo)用藥之外，對(duì)于微量DNA信號(hào)的特異性放大能力在cfDNA檢測(cè)及血液腫瘤治療后微小殘留病（MRD）的鑒定等領(lǐng)域也具有極大的優(yōu)勢(shì)。