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N端修飾蛋白(乙?;?、肉豆蔻?;┑暮铣?/h1>
來源:富士膠片和光(廣州)貿(mào)易有限公司   2024年02月22日 16:16  

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N端乙酰化和肉豆蔻?;堑鞍字凶畛R姷姆g后修飾之一,它們參與了蛋白的相互作用和亞細胞定位。為了闡明這些翻譯后修飾的重要性,需要比較分析修飾蛋白和未修飾蛋白。但是,在使用大腸桿菌等活細胞制備蛋白的常規(guī)方法中,受細胞中固有的修飾酶影響,難以控制和制備未修飾蛋白和修飾蛋白。


在本研究中,使用僅由參與蛋白合成的因子組成的PURE system(產(chǎn)品名稱:PUREfrex®),探討制備N端修飾目標蛋白的方法,并以wan全可控的狀態(tài)成功合成了乙?;蛉舛罐Ⅴ;牡鞍?。



◆由未甲?;某跏嫉鞍彼岷铣傻鞍?/span>


在使用常規(guī)PURE system的蛋白合成中,與大腸桿菌內(nèi)的翻譯反應相同,由甲?;牡鞍彼徇M行翻譯。但是,如果初始蛋氨酸的氨基被甲?;?,則不會發(fā)生N端修飾。因此,使用不含甲?;w(10-Formyl-tetrahydrofolate10-CHO-THF)的PURE system進行蛋白合成。結果表明,盡管不使用10-CHO-THF后合成效率有所降低,但仍成功合成了目標蛋白。

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◆NatB的N端乙?;?/strong>


酵母NatB是一種由yNaa20和yNaa25組成的異源二聚體酶,它能將乙酰CoA的乙?;D移至未甲酰化的初始蛋氨酸的氨基上。在不含10-CHO-THF的PURE system中加入目標蛋白、yNaa20及yNaa25的模板DNA和乙酰CoA進行反應。通過質譜分析合成的目標蛋白的N端肽,確認添加NatB DNA后被乙?;?/span>


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◆NatA的N端乙?;?/strong>


酵母NatA是一種由yNaa10和yNaa15組成的異源二聚體酶,它將乙酰CoA的乙?;D移至methionine aminopeptidase(MAP)切割初始蛋氨酸時暴露的第二個氨基酸的氨基上。因此,使用NatA進行乙?;瘯r,必須通過MAP去除N端的初始蛋氨酸。由于MAP會切割未甲?;某跏嫉鞍彼?,因在不含10-CHO-THF的PURE system中添加目標蛋白、yNaa10、yNaa15的模板DNA、純化MAP和乙酰CoA進行反應。通過質譜分析合成目標蛋白的N端肽,確認添加NatA DNA后被乙?;?/span>


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◆NMT的N端肉豆蔻?;?/strong>


NMT是一種可將MAP切割初始蛋氨酸后暴露出的第二個甘氨酸的氨基進行肉豆蔻?;拿?。由于底物肉豆蔻酰 CoA會抑制蛋白合成反應,因此需先在不含10-CHO-THF的PURE system中分別合成目標蛋白和NMT。然后,將分別合成的目標蛋白、NMT及肉豆蔻酰CoA混合,進行肉豆蔻?;磻Mㄟ^質譜分析合成目標蛋白的N端肽,確認添加NMT后被肉豆蔻酰化。

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此外,在脂質體中進行上述的肉豆蔻?;磻獣r,可觀察到肉豆蔻?;牡鞍自谥|體膜的定位狀態(tài)。


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● 實驗步驟概述(A)

● 去除初始蛋氨酸的GFP通過hNMT1(Δ80)在脂質體內(nèi)被肉豆蔻?;€可觀察到其向脂質體膜遷移(B)

● 根據(jù)3、6、9、12和24 h的反應時間繪制GFP膜定位的比率(C)

● 未添加肉豆蔻酰-CoA(D)或hNMT1(Δ80)基因(E)時,無法觀察到GFP的膜定位



總結


該項研究結果表明,通過使用PURE system,可在wan全可控下制備N端修飾蛋白,還可以確認翻譯后修飾的合成蛋白在脂質體膜上的定位。此外,PURE system還能合成修飾酶,無需純化即可用于修飾反應。該方法也適用于其他修飾酶,可以簡便地進行各種翻譯后修飾反應的分析和應用。


該項研究是GeneFrontier、東京工業(yè)大學和海洋研究開發(fā)機構(JAMSTEC)的共同研究。論文發(fā)表在ACS Synthetic Biology,可通過以下鏈接免費下載:
pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.3c00191

“Regulated N-Terminal Modification of Proteins Synthesized Using a Reconstituted Cell-Free Protein Synthesis System”
ACS Synthetic Biology (2023) 12, 1935-1942



相關產(chǎn)品:

PUREfrex® 無細胞蛋白合成試劑盒http://labchem.fujifilm-wako.com.cn/product/show/1610.html




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