TruSeq 接頭中*分子標識符的整合提高了定量測序的性
二代測序數(shù)據(jù)的定量分析要求區(qū)分重復讀長,重復讀長在PCR過程中由具有*起源的相同分子產(chǎn)生。通常PCR復制被定義為序列讀取,它以對齊為依據(jù),對齊到相同的基因組坐標上。然而,在文庫構建期間,相同的分子能夠獨立產(chǎn)生。作為PCR的復制品,分析時這些分子的錯誤識別能夠產(chǎn)生不可預見的偏愛。美國紐約大學科學家開發(fā)了一種性價比高的序列接頭,通過改進Illumina公司TruSeq接頭,結合*分子標識符(UMI)的設計,可以維持進行多重、單一指標測序的能力。UMIs結合到TruSeq接頭(即TrUMIseq 接頭)能夠識別真正的PCR產(chǎn)物,這些PCR產(chǎn)物帶有相同UMIs作為相同的圖譜讀取。使用TrUMIseq 接頭,在使用DNA測序的各種人群中和使用RNA測序的基因表達定量中, PCR復制品的移除提高了等位基因頻率估計的度和RNA測序基因表達定量。
原文:
Jungeui Hong and David Gresham. Incorporation of unique molecular identifiers in TruSeq adapters improves the accuracy of quantitative sequencing. BioTechniques 63:221-226 (November 2017)
相關產(chǎn)品
免責聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權或有權使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權不得轉載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權使用作品的,應在授權范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關法律責任。
- 本網(wǎng)轉載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負版權等法律責任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關權利。