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關鍵詞:細菌16S rDNA菌種鑒定技術服務|實驗技術服務
簡介:世界*品牌細菌16S rDNA菌種鑒定技術服務|實驗技術服務原裝,質(zhì)量保證,*。
細菌16S rDNA菌種鑒定技術服務|實驗技術服務——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經(jīng)驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。我們所有的實驗數(shù)據(jù)真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實驗報告重復我們的實驗結(jié)果。
產(chǎn)品品牌: http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>細菌16S rDNA菌種鑒定
16S rDAN是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA(16S rRNA)的基因。 長度約為1500pb,是細菌分類學研究中zui常用、zui有用的"分子鐘16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量適中,因此是進行分類研究的理想材料。利用16S rDNA兩端的引物PCR擴增未知菌株的16S rRNA基因,并進行DNA測序,與GenBank中的已知序列進行同源性比較后,判定細菌種類,將細菌劃分到屬或種。
提供擴增細菌16S rRNA的全長序列,約1,500 bp,進行進行全序列測序,BLAST,以得到較為全面的種屬特異性信息,確定樣品的種類。
服務要求
1. 請?zhí)峁┗蚪MDNA、經(jīng)菌種分離后帶有單菌落的新鮮平板或斜面。
2. 基因組DNA的濃度≥10 ng/μl,總體積≥20 μl,且無明顯降解;平板或斜面應長有分離的單菌落。
3. 由于革蘭氏陽性細菌或厭氧菌、放線菌等特殊菌株,請在服務委托書中加以說明。
4. 如果測序結(jié)果出現(xiàn)如下套峰,視為樣品不純,本公司將收取全額實驗費用。并建議克隆多個測序鑒定。
服務基本流程
1. 信諾金達進行引物設計合成;
2. PCR擴增16S rDNA;
3. PCR產(chǎn)物純化;
4. 測序,序列比對分析。
服務報告內(nèi)容
實驗報告包括PCR產(chǎn)物照片、NCBI序列比對鑒定結(jié)果、測序報告、序列堿基圖、以及剩余模板;
服務編號 服務項目 內(nèi)容說明 價格 周期
SGSBD01 細菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列比對分析 ¥400/樣品 1-2周*
SGSBD02 細菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列擴增,克隆測序,比對分析 ¥1000/樣品 2周
*價格不含DNA提取費用,如果樣品多或者特殊,時間協(xié)商。
技術特點
高通量:一次測序得到別以上條數(shù)的序列信息
高準確性:從幾個到幾十萬個拷貝的計數(shù)
高分辨率:可以檢測至單堿基差異
重復性好:深度測序保證了檢測的隨機性,可不需技術重復
成本低耗時短:相比于Sanger測序,價格及成本要低很多
生物信息學分析內(nèi)容
標準信息分析
1. Reads拼接,獲取Unique tags
2. OTU生成及統(tǒng)計分析
3. 物種注釋及豐度統(tǒng)計
4. 樣品OTU及物種豐度Heatmap圖
5. Alpha多樣性分析
6. Beta多樣性分析
定制化信息分析
1. 樣品差異主要因子分析
2. 樣品間主坐標分析(PCoA)
3. 樣品非加權配對平均法聚類分析(UPGMA)
4. 組間顯著性差異分析
5. 系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
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